实验室废弃物有多种分类方法，如按照废弃物的化学性质分类可以分为有机废弃物和无机废弃物。其中实险室有机废弃物是指在实验活动中产生的丧失原有价值或者虽未丧失利用价值但被抛弃或者放弃的固态、液态或者气态的有机类物质，包含有挥发性有机物、卤代烃、多环芳烃、有机金属化合物等；无机废弃物有重金属以及无机化合物等。

按废弃物的危害程度来分可以分为一般废弃物和有害废弃物。一般废弃物是指比较常见的、对环境和人体相对安全的废弃物，如实验室中装试剂及仪器的包装纸盒、废纸、废塑料、玻璃瓶、废铁等。一般废弃物经过回收处理后大多可以成为再生产品。有害废弃物即危险废弃物，是指具有腐蚀性、毒性、易燃易爆性、 反应性或者感染性等一种或者几种危险特性的废弃物。我国环保部公布了《国家危险废物名录》，共列举了498 种危险废物，这些废弃物的收集、贮存及处理需要根据相关法律法规及标准进行。

实验室废弃物还可以分为化学性废弃物、生物性废弃物和放射性废弃物。化学性废弃物是指实验室中使用或产生的废弃化学试剂、药品、样品、分析残液及盛装危险化学品的容器、被危险化学品污染的包装物和其它列入国家危险废物名录或者根据国家规定的危险废物鉴别标准和鉴别方法认定的具有危险特性的废弃物。生物性废弃物主要是开展生物性实验的实验室产生的，包括实验过程中使用过或培养产生的动植物的组织或器官、动物尸体、组织液及代谢物、微生物（细菌、真菌和病毒等）、培养甚等，还包括被微化物污染的实验耗材、实验垃圾等。这些实验废弃物若未经严格灭茵处理而直接排出，会造成严重的生物性污染后果。 放射性废弃物是指含有放射性核素或被放射性核素污染，其浓度或比活度大于规定的清洁解控水平，并且预计不再利用的物质，在一些生物实验室、医学实验室及矿物冶炼方面的实验室会产生放射性废弃物。

按照废弃物状态可分为固体废弃物、废液及废气。实验室的固体废物是实验活动中产生的固态或半固态废弃物质，实验室所产生的固体废物包括残留的固体试剂、多余固体试剂、沉淀絮凝反应所产生的沉淀残渣、消耗和破损的实验用品、残留的或失效的固体化学试剂以及生活垃圾等；废液主要有酸碱性废水、挥发性有机溶剂、低挥发性有机溶剂、含卤素有机溶剂、 含重金属废液、含盐废液等；废气有易挥发的有机蒸气、悬浮颗粒、有毒有害气体。实验室中废弃物的种类和排放量与所进行的试验有关。